混池測序——即混合群體分離分析法（Bulked Segregant Analysis, BSA），是利用極端性狀個體混池進行目標性狀基因定位的一種快捷方法。在分離群體中，選取極端性狀的子代DNA等量混合，對混合的“基因池”（GenePool）及親本分別進行建庫測序，計算不同文庫的測序數(shù)據(jù)在多態(tài)位點（SNP）的頻率（Allele Frequency，AF），與目標表型進行關聯(lián)，從而實現(xiàn)目標性狀相關的基因定位或者連鎖分子標記的開發(fā)。
1.大型動植物基因組分析經(jīng)驗豐富，深入挖掘生物群體意義； |
2.流程優(yōu)化，項目周期顯著降低； |
3.結合公共數(shù)據(jù)庫樣品信息聯(lián)合分析，節(jié)省成本； |
4.提供基因組數(shù)據(jù)構建服務，讓數(shù)據(jù)后期利用更加便利。 |
01
| 02 |
DNA總量≥500ng，濃度≥12ng/μl，無降解，無粘稠/顏色異常，無RNA/蛋白質(zhì)污染； | 使用無DNase管，標記清晰，干冰寄送。 |
期刊：Bmc Genomics 影響因子：4.547 發(fā)表時間：2019年
油菜（Brassica napus L.）突變體增加了每株植物的角果數(shù)目，但其分子機制仍不清楚。本研究結合BSA和全基因組重新測序（WGR）技術，使用來自近等基因系（NILs）zws-ms和zws-217研究與油菜多角果性狀相關的基因組區(qū)域。
研究結果
1、遺傳分析獲得了與油菜多角果性狀相關的3個SNP和2個InDel。
2、基于功能注釋的結果，篩選鑒定出與油菜多角果性狀相關的基因組區(qū)域和候選基因。
發(fā)表時間
| 文章標題
| 雜志名
| 影響因子
| 合作單位
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2021
| Using Combined Methods of Genetic Mapping and Nanopore-Based Sequencing Technology to Analyze the Insertion Positions of G10evo -EPSPS and Cry1Ab/Cry2Aj Transgenes in Maize
| Frontiers in Plant Science
| 5.754 | 浙江省農(nóng)業(yè)科學院
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2021
| BrLETM2 Protein Modulates Anthocyanin Accumulation by Promoting ROS Production in Turnip (Brassica rapa subsp. rapa)
| International Journal of Molecular Sciences | 4.556
| 東北林業(yè)大學
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2019
| Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus.
| BMC Genomics
| 3.594
| 四川農(nóng)業(yè)科學院
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