產品介紹

物種間存在廣泛的相互作用，包括寄生、共生、競爭等，而普通的轉錄組只能研究單一物種的信息，不僅浪費-部分數據，而且在分離中也會對樣本本身造成一定的影響。

互作轉錄組（Dual RNA-seq），無需分離兩物種，避免分離造成的干擾，只構建一個轉錄組文庫，便能同時對2個（或多個）物種進行測序和分析，從而揭示互作物種間基因表達的動態變化。同時，還可以通過互作模型圖獲得物種間基因的調控關系，得到兩物種間的相互作用機制。研究互作過程中的調控網絡、病原菌感染宿主致病機理和宿主抗病的機制；研究致病性菌在不同物種之間的進化關系、基于同源基因進一步發掘正選擇相關基因等。互作轉錄組主要是針對解決病原體和宿主之間互作的問題。主要特征在于同時對宿主和病原體進行測序和分析，主要區分與之前的單獨對宿主測序和分析，和單獨對病原體測序和分析。當然兩者同時測序和分析，主要是依賴于建庫和測序技術的提升。

技術流程

技術優勢

RNA總量：RNA總量≥2ug；

RNA純度：OD260/280在1.8-2.0之間，核酸完整無降解。

送樣要求

RNA總量：RNA總量≥2ug；

RNA純度：OD260/280在1.8-2.0之間，核酸完整無降解。

分析示例

各樣品reads 在unigene上覆蓋情況的IGV 展示截圖

表達量( FPKM scores )分布圖

樣品間聚類結果

差異基因可視化散點圖及火山圖

上下調差異基因GO注釋柱形圖

KEGG富集圖

表達差異基因聚類圖

WGCNA共表達網絡分析

蛋白網絡構建及分析(PPI)

宿主-病原菌互作模型（使用 FCM 方法對差異基因聚類圖）

宿主病原體互作網絡圖