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當前位置
Meta-Barcoding(eDNA)技術研究
產品介紹: 在生物多樣性和環境保護相關研究中,需要對生物多樣性進行有效的測量,以發現問題所在并對保護措施的有效性進行檢測。基于二代測序的高通量宏條形碼(Meta-Barcoding)技術,則針對既往研究中采樣費時費力、鑒定鑒定準確性的瓶頸問題提供了高效有利的技術解決方案。Meta-Barcoding技術,可以從環境樣本中收集總DNA,利用基因組特定基因的DNA序列,基于高通量測序技術對環境中存在的物種進行鑒定,目前已廣泛用于快快速物種鑒別。 Meta-Barcoding技術的原理是:選用細胞核或細胞器基因組特定基因上、短的DNA序列,進行針對性的擴增和測序,基于數據庫序列比對獲得物種的鑒定信息。該技術是在不同環境中鑒定物種種類和群落結構的重要研究方法。 技術流程:
分析流程:
樣本要求: 樣品類型1:環境樣本(請使用干冰或者冰袋運送) 1)土壤≧5g; 2)水體樣本,0.22μm的濾膜過濾后,送濾膜3-5張,-80℃保存,干冰運輸。 樣品類型2:DNA樣品(請使用干冰或者冰袋運送) 1)DNA總量≧150ng;濃度≧5ng/ul。 分析示例: OTU venn圖(花瓣圖)
多樣本物種組分柱狀圖
聚類樹與組分圖結合分析
樣本間距離計算(heatmap和箱式圖):
3D-PCA分析
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