微生物群落的結構、基因功能及代謝機理是微生物生態學的研究熱點。由于微生物的活動，使得微生物群落所在的環境樣本及生物學樣本具有生物活性功能，推動著自然界中重要的物質循環。因此，很多科學家在研究此類樣本時更關注功能基因簇的序列特征，以及特殊功能基因（如抗性基因、毒力基因等）的種類及豐度等。

云生物的宏基因組抗性基因檢測方案應運而出。通過宏基因組技術，高效準確的對環境樣本中抗生素抗性基因進行定性定量。