產品介紹

真核生物轉錄組（無參）測序，是獲得真核生物特定組織或細胞在某一狀態下轉錄出來的RNA的原始測序數據，質控后進行組裝獲得unigene，并以此為參考序列進行后續的功能注釋、SNP、SSR標記開發等分析，以及多個樣本的差異基因表達分析和差異基因功能富集分析等，發現新的功能基因，為進一步研究提供技術支撐。

針對真核生物，我們采用Illumina Truseq^TM RNA sample prep Kit方法構建文庫，其流程如下圖所示：

針對無參考基因組的轉錄組研究，獲得RNA-seq高質量測序數據后，需要將所有測序讀段通過從頭組裝生成重疊群（contig）和單一序列（singleton）, 此項分析是后續處理及生物學功能分析的基礎。 Trinity（http://trinityrnaseq.sourceforge.net/ , 版本號：trinityrnaseq-r2013-02-25） 是目前適用于Illumina 短片段序列組裝的一款比較權威的軟件，使用該軟件對所有clean data進行從頭組裝。

技術流程

技術優勢

1.可檢測未知基因，發現新的轉錄本；

2.豐富的項目經驗，組裝和注釋全方位分析基因表達水平和結構信息；

3.無需了解物種的基因或基因組信息，便可直接對任意物種進行全面的轉錄組分析。

送樣要求

RNA總量：≥2ug

RNA濃度：≥100 ng/ul

RIN值：≥7.0

分析示例