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原核鏈特異性轉錄組測序
產品介紹 原核鏈特異性轉錄組是研究有參考基因組物種轉錄組的一種有效手段。相對于傳統轉錄組測序而言,鏈特異性轉錄組可以確定兩條鏈的轉錄方向,為基因的進一步注釋和功能分析提供更準確的信息,同時還可以挖掘轉錄組中的non-coding RNA信息。原核生物鏈特異性轉錄組項目中,可以挖掘新的ncRNA與反義(antisense)轉錄本;還可以進行基因結構的研究,例如操縱子鑒定,為基因網絡調控的研究提供有力支持。同時探究細菌在不同時空條件下的基因表達變化,揭示基因組結構信息,深入挖掘sRNA調控信息。 技術流程
技術優勢 流程優化,項目周期顯著降低; 結合公共數據庫樣品信息聯合分析,節省成本; 提供組學數據構建服務,讓數據后期利用更加便利。 送樣要求 RNA總量:RNA總量≥2ug; RNA純度:OD260/280在1.8-2.0之間,核酸完整無降解。 分析示例 樣品基因表達水平聚類
差異基因可視化散點圖及火山圖
上下調差異基因GO注釋柱形圖
差異基因KEGG富集圖
表達差異基因聚類圖
sRNA預測
Snp信息統計
差異基因比較venn圖
WGCNA共表達網絡分析
差異基因KEGG注釋的泰森多邊形展示
基因集富集分析(GSEA)分析
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