產品介紹

全基因組關聯分析（Genome-wide association studies）又稱連鎖不平衡作圖（Linkage disequilibrium mapping）或關聯作圖（Association mapping），以連鎖不平衡為基礎，通過分子標記和性狀表型進行相關性分析來鑒定與目標性狀緊密關聯的標記或候選基因。利用RAD或GBS技術對某物種群體進行測序和全基因組關聯分析，與全基因組重測序相比，只獲得均勻分布于基因組的酶切位點附近的序列信息，降低了基因組的復雜程度和成本，尤其適合物種基因組大、樣本量大的研究項目。此外，基于RAD或GBS技術的GWAS不受參考基因組的限制，可開發無參考基因組物種性狀相關的分子標記，為后期的育種工作奠定基礎。  

技術流程

首先，對每個樣品中的RAD-tag進行比對歸類，按照每類tag的深度信息由大到小進行排序，得到每個個體的RAD-tag頻數表。

然后，每個樣品的RAD-tag內部進行比對得到樣品內部的雜合位點信息。

接著，不同樣品之間的RAD-tag進行互相的比對，尋找個體之間單堿基差異信息。

最后，綜合考慮每個個體RAD-tag的頻數表信息和比對信息，過濾掉可能來自重復區域的結果，從而得到高可信度的群體SNP標記基因分型結果。

技術參數

技術優勢

• 微量建庫技術，DNA總量只需2ug即可，流程優化，項目周期顯著降低；

• 穩定可靠，已開展簡化基因組樣本數十萬余例

• 團隊人員穩定，項目經驗豐富，核心技術人員均9年以上從業經驗，經驗豐富創新性強，可提供個性化分析服務；

• 流程優化，項目周期顯著降低；

• 結合公共數據庫樣品信息聯合分析，節省成本；

• 提供基因組數據構建服務，讓數據后期利用更加便利。

分析示例

性狀關聯分析

構建個體間進化樹

PCA主成分分析

群體structure分析

DAPC主成分判別分析

構建群體間進化樹