產品介紹

病毒（Virus）由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質（Protein）構成或僅由蛋白質構成（如 朊病毒）。根據遺傳物質的組成，將所有已知的病毒分為DNA病毒——單鏈DNA病毒，DNA病毒——雙鏈DNA病毒，DNA與RNA反轉錄病毒，RNA病毒——雙鏈RNA病毒，RNA病毒——單鏈、單鏈RNA病毒、裸露RNA病毒及類病毒等八大類群。此外，還增設亞病毒因子一類。目前病毒約4000種，設有三個病毒目，64個病毒科，9個病毒亞科，233個病毒屬，其中29個病毒屬為獨立病毒屬。亞病毒因子類群，不設科和屬。包括衛星病毒和prion（傳染性蛋白質顆粒或朊病毒）。一些屬性不很明確的屬稱暫定病毒屬。

病毒根據宿主類型的不同，可以分為噬菌體（細菌病毒）、植物病毒（煙草花葉病毒）和動物病毒（如禽流感病毒、天花病毒和HIV等）。

病毒基因組結構簡單，一般只含有單一核酸，在探究病毒的毒力系統、病毒的基因組進化與演變歷程方面意義深遠，可以為揭示病毒流行病變化趨勢等提供有力參考。

病毒全基因組測序，是指基于第二代高通量測序技術，對病毒全基因組進行測序，利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列，解析編碼信息，并獲得相應的變異信息。

技術流程

送樣要求

1、分析病毒感染樣本血清，-80 ℃保存，干冰運輸；

2、DNA/cDNA總量≧2ug，濃度≧100ng/ul，無降解，無粘稠，無顏色異常，無RNA/蛋白質污染；干冰寄送，使用無DNase管存放，標記清晰。

應用范圍

對全新的病毒進行測序，獲得框架圖/完整序列；

對基因組已知的病毒進行基因組重測序，進行多態性分析；

基因預測、功能注釋和比較基因組學(SNP、InDel. Pan-genome) 分析；

多種基因預測軟件確保基因預測的準確性；

分析示例

全基因組圖譜

全基因組結構變異類型配對圖

物種間進化樹

項目經驗：

1. A newly recorded Rickettsia of the Torix group is a recent intruder and an endosymbiont in the whitefly Bemisia tabaci. Environmental Microbiology (IF=5.147), 2020.

2. Epidemiological investigation and genomic characterization of Caprine herpesvirus 1 from goats in China. Infection. Genetics and Evolution (IF=2.611)， 2019.

3. Isolation and characterization of a bacteriophage and its potential to disrupt multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa biofilms. Microbial Pathogenesis (IF=2.581), 2019.

4. Complete genome analysis of the novel Enterococcus faecalis phage vB_EfaS_AL3. Archives of Virology (IF=2.261), 2019.

5. Isolation and characterization of a bacteriophage and its potential to disrupt multi-drug resistant. Microbial Pathogenesis (IF=2.332), 2019.