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當(dāng)前位置
基因組專題
研究背景受細(xì)菌強(qiáng)耐藥性影響，人類在與肺結(jié)核病斗爭(zhēng)的道路上步履維艱。新型抗生素的發(fā)現(xiàn)與生產(chǎn)成為攻克這一疾病的迫切需求... 小基因組研究包括：細(xì)菌基因組研究細(xì)菌基因組特色研究病毒（噬菌體）基因組和真菌基因組葉綠體&線粒體基因組抽提富集及測(cè)序1細(xì)菌基因組研究定義細(xì)菌的全基因組相對(duì)較小，具有重復(fù)序列較高、易于突變等特點(diǎn)，很有必要對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全基因組測(cè)序。細(xì)菌de novo測(cè)序已取代傳統(tǒng)方法稱為研究細(xì)菌遺傳進(jìn)化機(jī)制，關(guān)鍵功能基因的重要工具。云生物細(xì)菌基因組完成圖研究**策略：NGS+Pacbio/Nanopore研究特色... Genome-wide profiling of circulating tumor DNA depicts landscape of copy number alterations in pancreatic cancer with li... Genome-wide association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall and subtype-specific an... Genome-wide Identification of FHL1 as a Powerful Prognostic Candidate and Potential Therapeutic Targ5.736EBioMedicine . ... 廣闊的夜空有幾顆星，浩淼的海域有幾條魚，是科學(xué)界一直努力解答的問題。來自澳大利亞珀斯科廷大學(xué)的分子生物學(xué)家Micheal Bunce教授一直致力于解決第二個(gè)問題。澳大利亞珊瑚灣以海洋生態(tài)多樣、尤以珊瑚品種豐富聞名。2017年，Micheal... Landscape of Mitochondria Genome and Clinical Outcomes in Stage 1 Lung Adenocarcinoma6.162I期肺腺癌的線粒體基因組圖譜和臨床結(jié)局Cancers (Ba... Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the post-pandemic period41.037Science . 2020 May 22;368(6493)... Comparison of Bacterial DNA Profiles in Mid-Trimester Amniotic Fluid Samples From Preterm and Term Deliveries4.259Front ... 隨著越來越多的植物基因組的組裝，人們發(fā)現(xiàn)一個(gè)單一的參考組裝并不能反映一個(gè)物種的基因多樣性。泛基因組反映了基因組中的結(jié)構(gòu)變異和多態(tài)性，從而能夠深入比較物種水平或更高分類水平中的變異，同時(shí)泛基因組在作物改良、進(jìn)化和生物多樣性研究方面也有應(yīng)用潛力... 真菌屬于真核生物中分類地位較為特殊的一類生物，其種類已超過7萬多種，因部分真菌具有抗病毒、抗腫瘤、高營(yíng)養(yǎng)等特點(diǎn)，使得真菌備受關(guān)注。隨著測(cè)序技術(shù)和基因組組裝技術(shù)的不斷發(fā)展，越來越多的高質(zhì)量的真菌基因組被測(cè)序發(fā)表（如冬蟲夏草基因組、木耳基因組）... 豬鏈球菌（Streptococcus suis）被認(rèn)為是重要的抗藥性庫(kù)（AMR），有助于AMR基因向主要的鏈球菌病... 關(guān)于帶時(shí)間節(jié)點(diǎn)的系統(tǒng)發(fā)育樹，先給大家看一個(gè)例子：分支帶有物種的分化時(shí)間，并添加了分化時(shí)間的置信度范圍（右圖藍(lán)色數(shù)字... ITOL是Interaction Tree Of Life（網(wǎng)址：http://itol.embl .de/）的簡(jiǎn)... 在**篇分享中，我們介紹過進(jìn)化樹的類型有基因樹和物種樹的劃分（進(jìn)化研究專題(一) | 我有一棵樹 穿越數(shù)萬年）。研... 串聯(lián)法和并聯(lián)法構(gòu)建進(jìn)化樹串聯(lián)法(Concatenation)：先將不同物種之間的每個(gè)單拷貝基因單獨(dú)進(jìn)行多序列比對(duì)，... 核苷酸序列在不同位點(diǎn)有不同的突變速率。核苷酸序列又分為編碼基因和非編碼基因。編碼基因中，密碼子**第二位往往較為穩(wěn)... 在文章投稿時(shí)，經(jīng)常受到編輯直擊靈魂的拷問：“please explain how were amino-acid ... 多序列比對(duì)是進(jìn)化分析的基礎(chǔ)，有時(shí)用來區(qū)分一組序列之間的差異，但其主要用于描述序列之間的相似性關(guān)系，常用的軟件有 M... 系統(tǒng)發(fā)生樹（英文：phylogenetic tree或evolutionary tree）又名分子進(jìn)化樹，被認(rèn)為具... |
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