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當前位置
DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一, 在細菌、藻類及植物基因組中廣泛存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發揮作用。 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段,結合NGS測序技術在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
用心服務每一個項目 專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA甲基化完整解決方案; 國內較早開發6mA-seq技術團隊之一, 嚴格的內參質控; 已經完成藻類及動植物及人等多個物種6mA-seq項目經驗; 專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。 科學方案設計 從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析; 每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。 樣本類型和要求
數據分析
案例分析:衣藻基因組6mA甲基化譜研究 N6-Methyldeoxyadenosine Marks Active Transcription Start Sites in Chlamydomonas.Cell. 2015;7;161(4):879-892. 一、研究背景 N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型。6mA在細菌中廣泛存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發揮作用。相比之下,6mA在真核生物中的分布和功能還不清楚。 二、方法流程 取材:單衣藻(Chlamydomonas) 測序:6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq) 驗證:UHPLC-MS/MS: 整體6mA水平 三、研究結果 1、對衣原體基因組中的6mA進行了全面的分析,在84%的基因中鑒定出6mA修飾; 2、6mA主要位于轉錄起始位點(TSS)附近的AT二核苷酸上,具有雙峰分布,并顯示出激活基因的標記; 3、在6mA分布存在周期性模式, 與TSS附近的核小體分布有關,表明在核小體位置上可能起到作用。 四、研究結論 6mA的全基因組圖譜及其在衣藻基因組中的獨特分布表明6mA在真核生物基因表達中的潛在調控作用
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