一、 樣本組設(shè)計要求
項目的樣本組設(shè)計、樣本處理條件等對于檢測結(jié)果會有影響,對于發(fā)表文章的科學(xué)意義也至關(guān)重要。
我們參照文章審稿常見的問題,請您對樣本進行以下的核實:
樣本凍存之前,已經(jīng)確保離心除去細胞 (細胞冷凍破裂會影響外泌體純度);
樣本保存后,未經(jīng)過反復(fù)凍融,各樣本凍融次數(shù)一致;
每個樣本的處理條件一致,無顯著系統(tǒng)誤差:
o 樣本采集后,等待處理的時間、保存溫度、運輸方式和距離一致;
o 樣本處理步驟一致:如離心時間、溫度和速度;盡量是同樣的實驗員;
o 血漿:抗凝方法一致;
o 血清:制備條件參數(shù)較多,請確保完全一致;
樣本包括了適當(dāng)?shù)膶φ战M;
樣本組和對照組的處理條件一致性;
樣本組和對照組的入組和排除標(biāo)準(zhǔn):
o 樣本組和對照組:年齡、性別、地域分布一致;
o 更嚴(yán)格地,樣本組和對照組飲食習(xí)慣、BMI、飲酒、吸煙等習(xí)慣分布一致;
o 其他重要疾病的存在情況是否一致。
二、 樣本類型、送樣體積、建議的處理條件
1. 血漿或血清
· 由送樣單位采集血液,分離血漿或血清后-80度冷凍,干冰箱寄送;
· 樣本類型:
可檢測血漿或血清樣本;同一項目中制備方式保持一致。
血漿制備可以采用任何一種抗凝管
· 檢測用量:
o 如需要超離提取,樣本建議為每例3 ml;
o 如需SEC或超濾法提取,樣本需求為每例0.5 ml;
o 如選擇體液直接捕獲,樣本需求為每例0.1 ml;(支持96孔板送樣,建議使用0.2ml孔板,以耐-80度低溫鋁膜貼緊,每孔樣本體積0.1 ml。)
· 血漿分離步驟:
1. 取血樣,置于4度冷藏或冰上, 60分鐘內(nèi)按以下2步離心處理;
2. **步離心制備血漿:低速離心, 離心15分鐘,2000 g,取上層血漿,切勿吸出白膜層及紅細胞沉淀。若出現(xiàn)溶血,應(yīng)棄用;
3. 第二步離心去除其他沉淀:低速離心, 離心15分鐘,10000 g,去除沉淀,取上清液;
4. 取上層清液于新的離心管中 (最多裝至管的三分之二體積,以防冷凍后溢出)
5. 標(biāo)記:送樣管上有清晰標(biāo)記,送樣單上記錄對應(yīng)信息。
6. 于-80度保存。
· 血清分離步驟:
1. 按照實驗室SOP促凝血并離心制備血清;若出現(xiàn)溶血,應(yīng)棄用;
2. 第二步離心去除其他沉淀:低速離心, 離心15分鐘,10000 g,去除沉淀,取上清液;
3. 取上層清液于新的離心管中 (最多裝至管的三分之二體積,以防冷凍后溢出)
4. 標(biāo)記:送樣管上有清晰標(biāo)記,送樣單上記錄對應(yīng)信息。
5. 于-80度保存。
2. 其他體液(尿液、腦脊液、骨髓液、體內(nèi)積液、唾液、痰液、淚液)
· 檢測用量:
o 若需要外泌體提取,樣本需求為每例尿樣 > 10 ml,唾液> 3 ml,腦脊液 > 1 ml,骨髓液> 1 ml,體內(nèi)積液 > 3 ml,痰液> 1 ml。
o 若無需提取,樣本需求為體液樣本每例0.5 ml。
· 分離步驟:
1. 取體液,置于合適的離心管中,置于4度冷藏或冰上, 60分鐘內(nèi)按以下2步離心處理。若體液粘稠,如痰液、唾液,請加入PBS稀釋后進行離心去除細胞。
2. **步離心:低速離心, 離心15分鐘,2000 g,取上清液,若血液混入體液,請備注;若血液混入后出現(xiàn)溶血,應(yīng)棄用;
3. 第二步離心:低速離心, 離心15分鐘,10000 g,去除沉淀,取上清液;
4. 取上層清液于新的離心管中 (裝至最多三分之二體積),切勿吸出沉淀。
5. 標(biāo)記:送樣管上有清晰標(biāo)記,送樣單上記錄對應(yīng)信息。
6. 于-80度保存。
3. 細胞培養(yǎng)液等低濃度EV懸液
· 適用樣本:
細胞培養(yǎng)液、關(guān)節(jié)沖洗液、淚液收集、組織消化后上清液等樣本的EV提取產(chǎn)物均可檢測。
· 細胞系培養(yǎng)EV檢測注意事項:
o 請?zhí)峁┣‘?dāng)?shù)膶φ諛颖荆缭摷毎档耐蔚男迈r培養(yǎng)液;
o 盡量使用去外泌體牛血清exosome-depleted FBS (dExo-FBS)培養(yǎng)細胞。
· 分離步驟:
1. **步離心:低速離心, 離心15分鐘,2000 g,取上清液,沉淀應(yīng)棄用;
2. 第二步離心:低速離心, 離心15分鐘,10000 g,取上清液,沉淀應(yīng)棄用;
3. 取上層清液于新的離心管中 (裝至最多三分之二體積),切勿吸出沉淀。
4. 標(biāo)記:送樣管上有清晰標(biāo)記,送樣單上記錄對應(yīng)信息。
5. 于-80度保存。
4.已提純的EV樣本
· 適用樣本:
EV提取產(chǎn)物均可檢測。
· 注意事項:
o 外泌體提純產(chǎn)物以PBS重懸;
o 高濃度提純EV,送樣體積大于30μl,粒子濃度大于1010/ml。
o SEC產(chǎn)物直接送樣,無需濃縮,對應(yīng)至少50ul血漿或500ul尿液的提取產(chǎn)物
o 送樣管上有清晰標(biāo)記,送樣單上記錄對應(yīng)信息。
o 于-80度保存,且樣本冷凍于底部,無分散液滴。
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